反渗透阻垢剂的作用机理有三种:络合增溶、晶格畸变和静电排斥。
反渗透阻垢剂溶于水后，会发生电离反应，然后形成带负电荷的分子链。带负电荷的分子链与Ca2+会形成水溶性的络合物或螯合物，增加无机盐的溶解度，起到阻垢作用。由于反渗透阻垢剂分子中的一些能量基团占据了无机盐晶核或微晶上的一定位置，阻碍和破坏了无机盐晶体的正常生长，减缓了晶体的生长速度，从而减少了盐垢的形成。反渗透阻垢剂溶于水后，吸附在无机盐的微晶上，增加了颗粒间的斥力，阻碍了它们的聚结，使它们处于良好的分散状态，从而阻止或减少了水垢的形成。
